A gyógyüdülő komplexum az I. Világháború előtt élte fénykorát. A két Világháború között a fürdő környezetét beépítették, minek következtében a felszíni kutak vízhozama jelentős mértékben csökkent. A természetes gyógymód e népszerű eszköze már-már elapadni látszott, mikor váratlanul 1943-ban 536 méter mélyen a kutatók 49 fokos termálvízre bukkantak.
Nőgyógyászati fürdőkórház létesítését tervezték, az új lehetőséget azonban a II. Világháború kirobbanása miatt nem tudták kihasználni. A Háború után folytatták a már megkezdett munkálatokat, ám egy kormányrendeletnek megfelelően - és a régi álmokkal ellentétben - a dél-budai terület ellátására szolgáló, 362 ágyas, általános jellegű kórházat építettek. A Fővárosi Tanács Tétényi úti Kórháza 1950. június 20.-án nyitotta meg kapuit a rászorulók előtt.
A 60-as évek végén és a 70-es években jelentős mértékben megnőtt Dél-Buda lakosságszáma. A növekvő igények hatására a Kórházat új pavilonokkal bővítették: 1972-ben adták át a "C", majd 1978-ban a "B" épületet. A '70-es években lezajlott fővárosi kórház-integrációk keretében több intézményt is a Fővárosi Tanács Tétényi úti Kórházához csatoltak, minek köszönhetően az ágyak száma 1980-ban már elérte a 1143-at, s miután a dél-budai alapellátást is a kórházhoz vonták, az itt dolgozó munkatársak száma 2200 főre emelkedett.
Az 1990-es években részben az egészségügyi kapacitástörvény előírásai miatt, részben saját elhatározásból, valamint a "B" és "C" épületek komfortosításának következményeként a kórház ágyszáma fokozatosan csökkent. Megszűnt az integráció is. Az intézmény kötelékéből levált előbb a dél-budai alapellátás, majd a két kerületi szakorvosi rendelőintézet. Végül - 2003-ban - a kórház egy telephelyűvé vált.
A Szent Imre Kórház a szakorvos-képzésben, az orvos-továbbképzésben és a medikusok gyakorlati oktatásában egyaránt évtizedek óta részt vesz. 1999 őszén a SOTE az intézet Patológiai Osztályát teljes körű, az összes többi osztályt pedig részképzésre akkreditálta. Az akkreditációt 2008-ban megújították.
1999-ben kezdték meg a kórház teljes rekonstrukcióját, melynek első lépésében a műtéti szakmákat, valamint az intenzív ellátást magában foglaló "A" épület bővítését és átépítését valósították meg. Ennek keretében Központi Műtőblokkot alakítottak ki, folyamatosan működő, új Sürgősségi Egységet hoztak létre, korszerűsítették a hotelszolgálatot és modern, digitális eszközökkel látták el a célszerűen telepített képalkotó diagnosztikát.
A jelenleg 653 ágyas Szent Imre Kórházban az aktív ellátást a Sürgősségi Betegellátó Centrum, az Operatív Szakmák Mátrix Szervezete, a Belgyógyászati Szakmák Mátrix Szervezete, valamint az osztályszerkezetben működő Neurológia és Pszichiátria képviselik. A hosszabb idejű ápolást nyújtó egységek: a Neurológiai (Stroke-) Rehabilitációs Osztály, a Krónikus Pszichiátriai Osztály, a Krónikus Osztály és az - egyelőre közreműködőként itt üzemeltetett - Geriátriai és Geronto-pszichiátriai Rehabilitációs Osztály.
A kórház osztályainak számos beteg-klub, illetve egyesület köszönheti létrejöttét, ilyen például a már 20 éve működő Lipid Klub, a 16 éves Daganatos Betegek TUBA Klubja, valamint a nemrég létesített Őszirózsa Menopauza Klub, a Kismama Klub, a Szülésre Felkészítő Klub, a Gasztro Klub, a Cukorbeteg Klub, illetve a Sclerosis Multiplex Klub.